Алимов А. Ф.Элементы теории функционирования водных экосистем СПб.: Наука, 2001. - 147 с.
Алимов А. Ф.Продукционные характеристики озерных экосистем // Гидробиол. журн., 2000, т. 36, N1, с. 3 - 14.
Алимов А. Ф., Голубков С. М., Панов В. Е.Закономерности функционирования и стратегия управления экосистемами эстуария р. Невы // Экологическое состояние водоемов и водотоков бассейна реки Невы СПб.: Научный центр РАН, 1996. С. 187 - 203.
Алимов А. Ф., Бульон В. В., Голубков С. М. и др.Влияние рыб на структуру и функционирование экосистем озер-рыбопитомников // Биотические взаимоотношения в экосистеме озер-питомников СПб.: Гидрометеоиздат, 1993, с. 299 - 311.