С помощью разбиения Вороного-Делоне определены контакты между белками и нуклеиновыми кислотами в комплексах белок-ДНК. Приблизительно треть всех контактов составляют контакты с положи-тельно заряженными аминокислотами Arg и Lys, 32,3%. Ser и Thr дают в сумме следующий по величине вклад — 15%. Asn образует 6% контактов, также как и Gly. Установлено, что вклад каждой из остальных аминокислот не превышает 5%. Статистически значимыми являются контакты типа Asp-G, Trp-C, Glu-C, Asp-C и His-T. Предложен общий механизм участия отрицательно заряженных остатков в специфических взаимодействиях белок-ДНК.
Выявление аминокислот, играющих ключевую роль в образовании белок-белковых комплексов, необходимо для понимания природы этих комплексов. Мы решили задачу автоматического поиска контактирующих аминокислот в белок-белковых комплексах с помощью построения Вороного-Делоне. Был проведен расчет для 70 белок-белковых комплексов, и для оценки значимости каждого типа контакта была составлена матрица вероятности случайного его образования. Наибольшие отклонения от случайного распределения наблюдаются для контактов типа Leu-Val, Leu-Phe, Leu-Leu. Для белок-белковых комплексов одного типа (а именно антитело-антиген) наибольшие отклонения от случайного распределения наблюдаются для пар Leu-Phe, Phe-Ser.