Справочник "Биофизики России"

Рубин Андрей Борисович
Rubin Andrei B.

доктор биологических наук, член-корр. РАН; профессор

ИСТИНА • РИНЦ

Список публикаций, доступных в библиотеке сайта

[1-20] [21-40] [41-60] [61-80] [81-100] [101-120] [121-140] [141-160] >>

• Belyaeva N. E., Schmitt F.-J., Steffen R., Paschenko V. Z., Riznichenko G. Yu., Chemeris Yu. K., Renger G., Rubin A. B. PS II model-based simulations of single turnover flash-induced transients of fluorescence yield monitored within the time domain of 100ns–10s on dark-adapted Chlorella pyrenoidosa cells // Photosynth. Res., 2008, 98 105–119.
• Волгушева А. А., Кукарских Г. П., Антал Т. К., Лаврухина О. Г., Кренделева Т. Е., Рубин А. Б. Влияние дибромтимохинона на параметры флуоресценции хлорофилла а в клетках Сhlamydomonas reinhardtii, культивируемых на полной питательной среде и в условиях серного голодания // Биофизика. 2008. Т. 53. вып.5. С. 787-796
• Булычев А. А., Безменов Н. Н., Рубин А. Б. Влияние электрохимического градиента протонов на перенос электронов в фотосистеме I листьев гороха Физиология растений 2008, 55, № 4, 483-491
• Antal T., Rubin A. In vivo analysis of chlorophyll a fluorescence induction // Photosynth. Res. 2008. V. 96. P. 217-226
• Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Громов П. А., Устинин Д. М., Грачёв Н. Е., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Многочастичное компьютерное моделирование процессов электронного транспорта в мембране тилакоида // Биофизика, 2007, 52 (3) 492-502.
• Krasilnikov P. M., Mamonov P. A., Knox P. P., Paschenko V. Z., Rubin A. B. The influence of hydrogen bonds on electron transfer rate in photosynthetic RCs // BBA/Bioenergetics 2007, vol.1767, num.6, pp.541-549
• Kovalenko I. B., Abaturova A. M., Ustinin D. M., Riznichenko G. Yu., Grachev E. A., Rubin A. B. Miltiparticle Computer Simulation of Photosynthetic Electron Transport in the Thylakoid Membrane // Biophysics, 2007, Vol. 52, No. 5, pp. 481–488
  Further developing the method for direct multiparticle modeling of electron transport in the thylakoid membrane, here we examine the influence of the shape of the reaction volume on the kinetics of the interaction of the mobile carrier with the membrane complex. Applied to cyclic electron transport around photosystem I, with account of the distribution of complexes in the membrane and restricted diffusion of the reactants, the model demonstrates that the biphasic character of the dark reduction of P700⁺ is quite naturally explained by the spatial heterogeneity of the system.
• Максимов Г. В., Волков В. В., Паршина Е. Ю., Ахалая М. Я., Козлова О. В., Деринская Е. В., Ревин В. В., Рубин А. Б. Исследование конформации каротиноидов в миелиновом нерве при изменении содержания кислорода // Доклады Академии наук, 2007, т. 417, №3, с. 407‑409.
• Ахалая М. Я., Байжуманов А. А., Браже Н. А., Лунёва О. Г., Михайлов И. В., Брызгалова Н. Ю., Паршина Е. Ю., Максимов Г. В., Рубин А. Б. Модифицирующее действие оксида азота на белки плазмы крови и гемоглобин у крыс // Доклады Академии наук, 2007, т. 415, №6, с. 826‑828.
• Лукашев Е. П., Надточенко В. А., Перменова Е. П., Саркисов О. М., Рубин А. Б. Фотоперенос электронов между фотосинтетическими реакционными центрами бактерий Rhodobacter sphaeroides и полупроводниковыми мезопористыми пленками TiO₂ // Доклады Академии Наук, 2007, Т. 415 (№5), С.696-702.
• Makarova V. V., Kosourov S., Krendeleva T. E., Semin B. K., Kukarskikh G. P., Rubin A. B., Sayre R. T., Ghirardi M. L., Seibert M. Photoproduction of hydrogen by sulfur-deprived C. reinhardtii mutants with impaired Photosystem II photochemical activity // Photosynth. Res. 2007. V. 94. P. 79-89
• Volgusheva A. A., Zagidullin V. E., Antal T. K., Korvatovsky B. N., Krendeleva T. E., Paschenko V. Z., Rubin A. B. Examination of chlorophyll fluorescence decay kinetics in sulfur derived algae Chlamidomonas reinhardtii // Biochim. Biophys. Acta, 2007, 1767 559-564.
• Pinyaskina E. V., Belenikina N. S., Fraikin G. Ya., Rubin A. B. Red-Light induced recovery of yeast viability under the photodynamic effect of optical radiation Moscow University Biological Sciences Bulletin. 2007. V. 62. N 1. p. 26-29
• Antal T. K., Krendeleva T. E., Rubin A. B. Study of photosystem 2 heterogeneity in the sulfur-deficient green alga Chlamydomonas reinhardtii // Photosynth. Res. 2007. V. 94. P. 13-22
• Беляева Н. Е., Пашенко В. З., Ренгер Г., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Использование модели фотосистемы II для анализа индукционной кривой флуоресценции, вызванной насыщающим световым импульсом, во временном диапазоне 100 нс - 10 с // Биофизика, 2006, том 51, вып.6, с. 976-990
  Получены и проанализированы с помошью математической модели пропессов в фотосистеме II данные по измерению сигнала флуоресценции, возбуждаемой насыщающим импульсом длительностью 10 нс с помощью специального протокола освещения на препаратах термофильного штамма одноклеточной зененой водоросли Chlorella pyrenoidosa Chick (нативных и с диуроном) в диапазоне времени от 100 нс до 10 с. Аналиэ результатов моделирования показал, что в условиях короткого светового воздействия важен детальный учет процессов рекомбинации, в том числе безызяучательной в фотосистеме II, а дальнейший перенос зарядов в электрон-транспортной цепи тилакоидиой мембраны можно описывать одной реакцией повторного окисления хинолов. Включение в модель фотосистемы II реакций ингибирования диуроном электронного транспорта в акцепторной части фотосистемы II позволило описать кривые индукции флуоресценции, регистрируемые в присутствии диурона. Определены параметры модели (pH стромы, константы скоростей реакций безызлучательчой рекомбинации, начальная восстановленность пула хинонов), при которых адекватно описаны наблюдаемые в эксперименте соотношения максимального и начального уровней флуоресценции (Fm/Fo).
• Красильников П. М., Нокс П. П., Хейнникел М., Рубин А. Б. Кинетика индуцируемого постоянным светом пигмент-акцепторного взаимодействия в препаратах фотосистемы I Synetchocystis sphaeroides, охлажденных до 160 К в темноте и на свету Биофизика, 2006. т. 51, вып. 1, с. 65-72.
• Belyaeva N. E., Pashchenko V. Z., Renger G., Riznichenko G. Yu., Rubin A. B. Application of a Photosystem II Model for Analysis of Fluorescence Induction Curves in the 100 ns to 10 s. Time Domain after Excitation with a Saturating Light Pulse // Biophysics, 2006, Vol. 51, No. 6, pp. 860–872
  A mathematical model of photosystem II (PSII) events was used to analyze chlorophyll fluorescence transients in the time domain from 100 ns to 10 s after excitation with a saturating 10-ns flash, applied as a part of specialized illumination protocol, using preparations of a thermophilic strain of the unicellular green alga, Chlorella pyrenoidosa Chick (using both intact and diuron-treated cells). Analysis of simulation results has proven that particular attention should be given to flash-induced recombination processes, including nonradiative recombination in PSII, while subsequent charge transfer along the electron transport chain of thylakoid membrane can be adequately described by a single reaction of quinone reoxidation. The PSII model was extended by taking inhibition by diuron of the electron transport in the acceptor side of PSII into account, which allowed simulation of fluorescence induction curves observed in the presence of this inhibitor. The model parameters were determined (stromal pH, rate constants of nonradiative recombination, and the initial reduction state of the quinone pool) which provided adequate simulation of experimentally observed ratios of the maximal and initial fluorescence levels (Fm/Fo).
• Kovalenko I. B., Abaturova A. M., Gromov P. A., Ustinin D. M., Grachev E. A., Riznichenko G. Yu., Rubin A. B. Direct simulation of plastocyanin and cytochrome f interactions in solution // Phys. Biol., 2006, vol. 3, pp. 121–129
  Most biological functions, including photosynthetic activity, are mediated by protein interactions. The proteins plastocyanin and cytochrome f are reaction partners in a photosynthetic electron transport chain. We designed a 3D computer simulation model of diffusion and interaction of spinach plastocyanin and turnip cytochrome f in solution. It is the first step in simulating the electron transfer from cytochrome f to photosystem 1 in the lumen of thylakoid. The model is multiparticle and it can describe the interaction of several hundreds of proteins. In our model the interacting proteins are represented as rigid bodies with spatial fixed charges. Translational and rotational motion of proteins is the result of the effect of stochastic Brownian force and electrostatic force. The Poisson–Boltzmann formalism is used to determine the electrostatic potential field generated around the proteins. Using this model we studied the kinetic characteristics of plastocyanin–cytochrome f complex formation for plastocyanin mutants at pH 7 and a variety of ionic strength values.
• Антал Т. К., Волгушева А. А., Кукарских Г. П., Кренделева Т. Е., Тусов В. Б., Рубин А. Б. Исследование изменений параметров флуоресценции хлорофилла в клетках Chlamydomonas reinhardtii в условиях серного голодания // Биофизика, 2006, 51(2), стр. 292-298
• Маторин Д. Н., Погосян С. И., Осипов В. А., Хаптер Р., Рубин А. Б. Исследование состояния фотосинтетического аппарата фитопланктона Балтийского моря флуоресцентными методами Вестник МГУ, сер. Биология. № 1, 2006. 61-66

[1-20] [21-40] [41-60] [61-80] [81-100] [101-120] [121-140] [141-160] >>

Условные обозначения:


• научный журнал

Дополнительная информация

• Информация в Интеллектуальной Системе Тематического Исследования НАукометрических данных (ИСТИНА)
• Информация в eLibrary (РИНЦ)