Изучено влияние полиэлектролита полиаллиамина на структуру и каталитические характеристики уреазы (Canavalia ensiformis) методами стационарной кинетики, флуоресцентной спектроскопии и кругового дихроизма. Показано, что данный полиэлектролит является сильным ингибитором уреазы (при концентрации ПАА 0,5 мкг/мл фермент заингибирован на 50% при нейтральных значениях рН). Предложен механизм ингибирования уреазы полиэлектролитом, в котором основную роль играют специфические катион-сзывающие сайты на молекуле уреазы, определяющие структурную динамику комплекса фермент-полиэлектролит.
Создание ферментативных полиэлектролитных микрореакторов выдвигает определенные требования к свойствам ферментов — изоэлектрической точке белка — рI, величине его полного заряда Q, но особенно важно точное знание распределения электростатического потенциала (РЭП) на поверхности белка. Настоящая работа посвящена расчету РЭП ряда белков с учетом различного локального окружения для каждого заряженного аминокислотного остатка и соответственно смещения величины рКа. Было рассчитано РЭП рибонуклеазы А и лизоцима при разных значениях рН 4, 5, 6, 7, 8, применяя как обычно используемые стандартные значения величин рКа, так и с учетом локального окружения для каждого титруемого аминокислотного остатка белка. В результате сравнения таких расчетов показано, что учет окружения аминокислотного остатка изменяет РЭП ферментов, но в ограниченной области рН (3–5). Произведена оценка площадей с соответствующим РЭП на поверхности белка, потенциально способных связывать полиэлектролиты, составляющие оболочку фермент-полиэлектролитного комплекса. В интервале рН (5–8) расчет РЭП этих белков показал, что поправка на смещение величин рКа не вызывает заметных изменений РЭП и при построении надмолекулярных комплексов ее можно не учитывать.
Сабурова Екатерина Андреевна